[1]郭 俊,蔡 伦,李小燕,等.目标基因捕获结合第2代测序技术检测原发性高血压致病基因突变[J].新乡医学院学报,2014,31(06):414-416,419.[doi:10.7683/xxyxyxb.2014.06.002]
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目标基因捕获结合第2代测序技术检测原发性高血压致病基因突变
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《新乡医学院学报》[ISSN:1004-7239/CN:41-1186/R]

卷:
31
期数:
2014年06
页码:
414-416,419
栏目:
出版日期:
2014-06-05

文章信息/Info

作者:
首都医科大学附属北京安贞医院 北京市心肺血管疾病研究所教育部心血管重塑相关疾病重点实验室,北京
10002

关键词:
分类号:
R544.1
DOI:
10.7683/xxyxyxb.2014.06.002
文献标志码:
A
摘要:
目的 建立目标基因捕获结合第2代测序技术,对原发性高血压(EH)患者的13个已知致病基因进行突
变筛查,探讨EH与致病基因突变的关系。方法 提取5例EH患者外周血全基因组DNA,利用GenCap目标基因捕
获技术,设计内皮素转化酶1(ECE1)、G蛋白调节信号5(RGS5)、钠钾三磷腺苷酶通道β1多肽(ATP1β1)、选择素E
(SELE)、血管紧张素原(AGT)、血管紧张素受体1(AGTR1)、α内收蛋白(ADD1)、细胞色素P4503A亚家族多肽5
(CYP3A5)、一氧化氮合酶3(NOS3)、鸟嘌呤核苷酸结合蛋白β3(GNβ3)、一氧化氮合酶2A(NOS2A)、苯基乙醇胺N
甲基转移酶(PNMT)和前列腺素I2合成酶(PTGIS)基因外显子区域特异性捕获探针,与基因组DNA文库进行杂交,
将目标基因组区域的DNA片段进行富集后,再利用IlluminaHiSeq2000第2代测序仪进行测序,通过数据分析,确定
突变位点,对选定的突变位点用Sanger测序法验证。结果 设计合成的目标基因特异性捕获探针可有效捕捉并富集
基因组DNA的目标靶片段。目标区域平均测序深度为301.12~431.92,99.30% ~99.70%目标区域覆盖度。5例患
者中ADD1基因发现3个错义突变;AGT基因发现1个错义突变;SELE基因发现2个错义突变;PNMT基因发现1个
剪切位点突变;PTGIS基因发现1个错义突变。结论 GenCap目标基因捕获技术结合IlluminaHiSeq2000第2代测
序技术成功发现了EH患者的致病基因突变。该方法快速有效,对深入研究EH的分子病因学有重要意义。
关键词: 原发性高血压;致病基因;目标基因捕获;第2代测序
中图分类号:R544.1

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更新日期/Last Update: 2014-05-28